农业专项资金，包括预算安排的农业专项支出，预算外农业专用资金，政策性农业专项贷款，以及外资运用农业项目的资金。对农业专项资金审计，是指审计机关依法对农业专项资金财政、财务收支的真实、合法和效益进行的审计监督。近年来，随着国家对农业投入的逐年增加，审计部门组织开展了一系列农业专项资金审计和审计调查，均取得了一定成效。随着形势的发展，党和政府以及社会各界对“三农”问题也愈来愈关注，在这种大环境下，如何深化农业专项资金审计，提高计质量水平呢？我们认为应做好以下几方面工作：
　　一、抓好重点资金、重点单位、重点项目的审计是搞好农业专项资金审计的关键
　　（一）抓好重点资金的审计。从近几年农业专项资金审计的实践看，抓住重点资金审计，一方面能反映出农业资金管理使用的现状和存在的主要问题，另一方面能引起政府领导和有关部门对“三农”方面存在问题的重视，达到事半功倍的效果。近些年来，市审计局组织开展了对同发展资金、“两化”资金、扶持龙头企业资金、扶贫资金、水利资金、农业专项发展资金、农业综合开发资金等重点资金的审计，不仅揭露查处了专项资金运用方面存在的问题，规范了专项资金的使用，取得了较好的成绩，也引起政府部门对相关问题的重视。如通过我处去年对农业专项资金的审计，不仅使政府有关部门加强了对农业专项资金的使用管理，也促进了政府有关部门重视农业专项资金的规范管理，出台规范性文件，建章立制，完善规章制度，审计建议也得到了有关部门的采纳。
　　（二）抓住重点单位的审计。农业专项资金分布点多面广，其中财政、农业主管部门不仅拥有农业资金的分配使用权，而且拥有农业资金的监督权。抓住了重点单位审计，就抓住了龙头。如在去年我们重点对某局下属单位的农业专项资金审计中，查出该单位挤占农业专项资金33.38万元，主要用于列支加班和招待费以及另一下属单位虚报专项经费10万元等问题，引起了有关部门的高度重视。
　　（三）抓好重点项目的审计。重点项目资金投入量大，而且具有代表性，加强重点项目的审计对提高农业专项资金的使用效益，促进解决好农业发展中重大的、宏观性的和政策性的问题是非常必要的。如农村外口公寓、通用厂房，水利工程，道路等，投资额少则几十万元，多则上千万元，工程建设对促进经济发展，增加农民收入起到重要作用。如在对同发展项目的专项资金审计中，我们选定了同发展补助资金100万元以上的9个项目进行审计调查，发现部分建设项目进度缓慢或未按规定实行工程招投标；由于建设项目选址不慎或政府规划调整等原因，导致2个项目无法开工；个别区部分同发展补助资金未能及时拨付到位以及农业专项资金使用单位会计核算不规范等问题，引起了相关部门的重视。
　　二、行之有效的审计方法是搞好农业专项资金审计的保证
　　（一）坚持审计和审计调查相结合，发挥各自所长，提高农业审计监督效果。
　　审计相对审计调查来讲，在审计深度上具有优势，利于进行“解剖麻雀式”的审计监督，容易查深查透和弄清事情的来龙去脉，明确责任归属，处理力度也一般较大，加上被审计单位相对单一，便于敦促整改，见效较快，但具有范围相对狭窄的缺陷，延伸审计相对困难。审计调查具有范围广涉及面宽，而且相对来说，调查的事项限制较少，容易合理展开和延伸调查，能够从相对较大的层面上把握情况，掌握许多带有共性和普遍性的问题，代表性强，利于整体把握事物全貌，但相对来说，深度方面不如审计。正是由于审计和审计调查各有所长，《审计署2003至2007年审计工作发展规划》中明确提出，将来要实现审计和审计调查项目各占一半的比例。
　　农业审计由于行业的特殊性，许多项目属于资金量小涉及面广的类型，在履行审计监督职责时，必须保证合理的监督面，因此客观上应多开展审计调查，在调查的过程中，若发现确实有必要进行深入解剖的，再转入审计项目，这样将两者结合起来，更有利于提高农业审计的整体效果。
　　（二）采用分析性复核、现场实地调查、点面结合等多种审计方法，将账面审计与深入乡镇、农户调查结合起来，以核实资金支出的真实性。农业专项资金的财务往往集中在财政或有关的实施主管部门，就帐、表、证进行账面审计，以摸清农业专项资金投入的总体规模，掌握支出的结构是非常必要的；在此基础上必须延着资金流向，深入乡镇、农户及项目实施地进行检查，才能最终核实资金支出的真实性。如我们在某单位农业专项资金审计中，发现有一农场以种植牧草为由，向该单位申请补助经费10万元，通过账面审计与延伸调查相结合，深入农场和基地，发现该农场并未组织牧草种植，而是将75亩土地租给肉牛饲养场经营，至年底该专款仍未使用，虚报经费补助10万元。又如某食品冷冻公司向财政申请建设冷冻库房补助资金30万元，经现场检查，发现该单位并未建设冷库，而是将补助用金用于建设食堂和内部招待所，未经批准擅自改变了项目的建设用途，挤占挪用了项目建设资金。因此运用分析性复核方法，深入现场实地调查了解，才能发现用款单位是否存在虚报项目骗取财政资金或挤占、挪用项目建设资金的问题。
　　（三）将专项资金审计与基本建设项目审计相结合，以核实项目支出的正确性。农业专项资金多数是以建筑工程、水利工程、道路建设等形式实施的，多数项目都可通过审计工程决算的办法，核实专项资金的使用情况。审计必须牢牢抓住项目和资金、工程决算和财务决运行和资金运用的轨迹来进行监督，全面客观地反映项目的建设情况。审计除了对资金拨付环节进行审计外，还应加强对项目建设情况的审计。一方面审计有关项目建设支出账，检查支出的真实性、合理性、合法性；另一方面深入项目建设现场，对项目质量、项目数量等进行实地核对，对照项目计划书中建设内容审核其完成情况，看其是否符合计划要求，有无旧工程新决算、小工程大决算等套取国家专项资金等违法违规问题。因此将农业专项资金审计与基本建设项目审计结合起来，是深化专项资金审计的需要。

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